1、生物效應(yīng)是瞬時(shí)的

　　通過對(duì)體內(nèi)活性蛋白前體的激活而迅速表現(xiàn)出活性。因?yàn)闊o需通過基因復(fù)制轉(zhuǎn)錄及表達(dá)等復(fù)雜的過程，所以能迅速對(duì)外界信號(hào)作出反應(yīng)。此外這種反應(yīng)又是定向而不可逆的，不同于體內(nèi)其他一些酶的生物調(diào)控機(jī)制，例如一些磷酸化激酶，通過對(duì)蛋白質(zhì)的磷酸化及去磷酸化使產(chǎn)生變構(gòu)效應(yīng)，從而進(jìn)行可逆的生物調(diào)控。

　　2、以級(jí)聯(lián)反應(yīng)的方式表達(dá)

　　即在第一級(jí)反應(yīng)中被激活的蛋白質(zhì),本身就是催化下一級(jí)反應(yīng)的蛋白酶,這樣就起著逐級(jí)放大的作用。例 2如一分子酶即使以很低的水平催化1000個(gè)分子底物反應(yīng)，經(jīng)兩級(jí)催化反應(yīng)后就放大了100萬倍,因而機(jī)體對(duì)微弱的外界信號(hào)也能產(chǎn)生很強(qiáng)的生物效應(yīng)。

　　3、存在正負(fù)反饋系統(tǒng)

　　從而使整個(gè)多級(jí)反應(yīng)體系處于最佳狀態(tài)，例如在血凝過程中被激活的凝/血酶既能催化血纖維蛋白原使之轉(zhuǎn)變?yōu)檠w維蛋白，又能激活凝/血因子Ⅷ及Ⅴ，后者又進(jìn)一步促進(jìn)凝/血酶原的激活，這是正反饋，但凝/血酶又能自身降解凝/血酶原，使之不能再被激活，這是負(fù)反饋。

　　在催化同一活性蛋白前體時(shí)有時(shí)能產(chǎn)生兩種或兩種 以上生物功能各不相同的組分

　　例如促腎上腺激素、β-促脂肪激素及內(nèi)啡肽都由同一前體蛋白水解產(chǎn)生。

　　參與生物調(diào)控的蛋白酶有時(shí)可通過兩種不同途徑產(chǎn)生同一生理效應(yīng)，彼此間起到一定的互補(bǔ)作用。例如凝/血反應(yīng)中既有血液中的內(nèi)源性激活系統(tǒng)，又有組織中的外源性激活系統(tǒng),兩者最后都通過凝/血因子X使凝/血酶原激活。

　　在蛋白酶所參與的一些重要生物調(diào)控體系中幾乎毫無例外都有相應(yīng)的蛋白酶抑制劑存在。若在某些體系中蛋白酶與其相應(yīng)抑制劑的平衡失調(diào)，就會(huì)引起病變。例如先天性靜脈血栓和血管神經(jīng)性浮腫往往是與體內(nèi)缺乏相應(yīng)的抗凝/血酶抑制劑Ⅲ及補(bǔ)體C1抑制劑有關(guān)。